2009 års modell är densamma som 2008 med undantag för en förändrad färgsättning och dekaler. Denna modell såldes även under 2010 utan förändringar.
Nyheter till 2008: Nytt framdäck, Dunlop 742FA, ny mindre tank och smalare sadel. Nya lättare bromsskivor, ny nedre gaffelkrona med 22mm offset.
Honda fortsätter att uppdatera CRF250X’en. Till 2007 finner vi: Ny portning i cylindern, inspirerad av R-modellen (crossen). Ny kolv och kolvringar från CRF250R.
Första året med CRF250X som är Hondas enduroversion av CRF250. Största skillnaderna mellan crossversionen är: